М 54 Методы молекулярного моделирования супрамолекулярных комплексов: иерархический подход / Ф. В. Григорьев, А. Н. Романов [и др.] // Российские нанотехнологии. - 2010. - Т. 5 , № 5-6 . - С. 47-53 : рис. - Библиогр. : с. 53 (30 назв.) . - ISSN 1992-7223
Рубрики: ТЕХНИКА. ТЕХНИЧЕСКИЕ НАУКИ Кл.слова (ненормированные): КОМПЛЕКСЫ СУПРАМОЛЕКУЛЯРНЫЕ -- МЕТОДЫ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ -- ПОДХОД ИЕРАРХИЧЕСКИЙ Аннотация: Предложен оригинальный иерархический подход к определению структуры, устойчивости и свойств супрамолекул (СМ), образованных двумя и более молекулами (или молекулярными фрагментами наночастицы), с использованием методов молекулярного моделирования (ММ). Расчет структуры исходных компонент СМ осуществляется методами квантовой химии. Поиск возможных конфигураций СМ предложено осуществлять с использованием генетического алгоритма глобальной оптимизации и классического силового поля для расчета потенциальной энергии взаимодействия компонентов СМ. Для расчета уточненной геометрии найденных конфигураций, их относительной стабильности и требуемых свойств предложено снова использовать методы квантовой химии. Свободная энергия образования СМ может быть определена в квазигармоническом приближении с использованием молекулярно-динамического моделирования. Указанные выше методы и стратегия вычислений реализованы в программе INDAM, входящей в состав программного комплекса NANOMODEL для многомасштабного моделирования структуры и свойств наноразмерных комплексов |